| 當期課號 | 7245 | Course Number | 7245 |
|---|---|---|---|
| 授課教師 | 陳永福 | Instructor | CHEN,YUNG FU |
| 中文課名 | 計算生物學 | Course Name | Computational Biology |
| 開課單位 | 資訊管理系碩士班二A | Department | |
| 修習別 | 選修 | Required/Elective | Elective |
| 學分數 | 3 | Credits | 3 |
| 課程目標 | 人類基因組是由大約三十億鹼基對(A, T, C, G)所組成。將這些資料的順序正確排列就是基因定序。而這只是一個開端而已，隨之而來的是更大量的分析資料，在這大量的資料裡，有用的資料卻是隱藏在許多雜訊之中，計算生物學領域就是要找出有用的資訊，其主要的重點是有關如何儲存、管理、傳輸、進而分析生物相關的大量資訊。 | Objectives | 1.Sequence Alignment 2.Evolutionary Trees 3.Superstrings 4.Protein Structure 5.System Biology 6.String Matching 7.Superstructures 8.RNA Structures 9.Genome Rearrangement 10.Pattern Discovery 11.Divide-and-Conquer 12.Sorting by Reversal 13.Visual Display |
| 教材 | Bioinformatics and Functional Genomics by J. Pevsner, Wiley-Liss 2003 | Teaching Materials | Bioinformatics and Functional Genomics by J. Pevsner, Wiley-Liss 2003 |
| 成績評量方式 | 1. 出席：10% 2. 作業：30% 3. 期中考試：30% 4. 期末報告：30% |
Grading | 1.Attendance:10% 2.Homework: 30% 3.Mid-Term Exam:30% 4.Final Exam:30% |
| 教師網頁 | www.csie.dyu.edu.tw/~yfbchen/ | ||
| 教學內容 | Chap 0: Cell Function, Protein and DNA （細胞功能、蛋白質、DNA）、Transcription and Translation （基因之轉錄及轉譯） Chap 1: Introduction to Bioinformatics（生物資訊學簡介） Chap 2: Access to Sequence Data and Literature Information（基因序列資料和文獻資訊存取） Chap 3: Pairwise Sequence Alignment （雙序列比對） Chap 4: Basic Local Alignment Search Tool (BLAST序列比對工具 ) Chap 5: Basic Local Alignment Search Tool (BLAST序列比對工具 ) Chap 6: Bioinformatic Approaches to Gene Expression（利用生物資訊探討基因表現） Chap 7: Gene Expression: Microarray Data Analysis（基因表現：微晶片陣列資料分析） Chap 8: Protein Analysis and Proteomics（蛋白質分析及蛋白質體學） Chap 9: Protein Structure（蛋白質結構） Chap 10: Multiple Sequence Alignment（多序列比對） Chap 11: Molecular Phylogeny and Evolution（分子種系和演化） Chap 12: Completed Genomes and the Tree of Life（已完成之生物基因體和生命樹） |
Syllabus | Chap 0: Cell Function, Protein and DNA, Transcription and Translation Chap 1: Introduction to Bioinformatics Chap 2: Access to Sequence Data and Literature Information Chap 3: Pairwise Sequence Alignment Chap 4: Basic Local Alignment Search Tool Chap 5: Basic Local Alignment Search Tool Chap 6: Bioinformatic Approaches to Gene Expression Chap 7: Gene Expression: Microarray Data Analysis Chap 8: Protein Analysis and Proteomics Chap 9: Protein Structure Chap 10: Multiple Sequence Alignment Chap 11: Molecular Phylogeny and Evolution Chap 12: Completed Genomes and the Tree of Life |